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Architecture Exploration of FPGA Based Accelerators for BioInformatics Applications

Architecture Exploration of FPGA Based Accelerators for BioInformatics Applications
Kataloginformation
Feldname Details
Vorliegende Sprache eng
ISBN 978-981-10-0589-3
Name Varma, B. Sharat Chandra
Paul, Kolin
Name ANZEIGE DER KETTE Paul, Kolin
Name Balakrishnan, M.
T I T E L Architecture Exploration of FPGA Based Accelerators for BioInformatics Applications
Auflage 1st ed. 2016
Verlagsort Singapore
Verlag Springer
Erscheinungsjahr 2016
2016
Umfang Online-Ressource (XV, 122 p. 54 illus., 40 illus. in color, online resource)
Reihe Springer Series in Advanced Microelectronics ; 55
Notiz / Fußnoten Description based upon print version of record
Titelhinweis Druckausg.ISBN: 978-981-10-0589-3
ISBN ISBN 978-981-10-0591-6
Klassifikation TJFC
TEC008010
TEC008010
TJFC
TEC
621.3815
TK7888.4
Kurzbeschreibung Introduction -- Related Work -- Methodology for Implementing Accelerators -- FPGA based Acceleration of Protein Docking -- FPGA based Acceleration of De Novo Genome Assembly -- Design of Accelerators with HEBs -- System Level Design Space Exploration -- Future Directions.
2. Kurzbeschreibung This book presents an evaluation methodology to design future FPGA fabrics incorporating hard embedded blocks (HEBs) to accelerate applications. This methodology will be useful for selection of blocks to be embedded into the fabric and for evaluating the performance gain that can be achieved by such an embedding. The authors illustrate the use of their methodology by studying the impact of HEBs on two important bioinformatics applications: protein docking and genome assembly. The book also explains how the respective HEBs are designed and how hardware implementation of the application is done using these HEBs. It shows that significant speedups can be achieved over pure software implementations by using such FPGA-based accelerators. The methodology presented in this book may also be used for designing HEBs for accelerating software implementations in other domains besides bioinformatics. This book will prove useful to students, researchers, and practicing engineers alike.
SWB-Titel-Idn 468158979
Signatur Springer E-Book
Bemerkungen Elektronischer Volltext - Campuslizenz
Elektronische Adresse $uhttp://dx.doi.org/10.1007/978-981-10-0591-6
Internetseite / Link Volltext
Siehe auch Volltext
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