| Vorliegende Sprache |
ger |
| Hinweise auf parallele Ausgaben |
340017716 Buchausg. u.d.T.: ‡Eckstein, Silke: Informationsmanagement in der Systembiologie |
| ISBN |
978-3-642-18233-4 |
| Name |
Eckstein, Silke |
| T I T E L |
Informationsmanagement in der Systembiologie |
| Zusatz zum Titel |
Datenbanken, Integration, Modellierung |
| Verlagsort |
Berlin, Heidelberg |
| Verlag |
Springer-Verlag Berlin Heidelberg |
| Erscheinungsjahr |
2011 |
| 2011 |
| Umfang |
Online-Ressource (X, 268S. 139 Abb., 35 Abb. in Farbe, digital) |
| Reihe |
SpringerLink. Bücher |
| Notiz / Fußnoten |
Includes bibliographical references and index |
| Weiterer Inhalt |
Vorwort; Inhaltsverzeichnis; 1 Einleitung ; 1.1 Systembiologie; 1.2 Systembiologie aus einer Informatikperspektive; 1.3 Datenbanken; 1.4 Integration; 1.5 Modellierung; 2 Biologische Grundlagen ; 2.1 Das Humangenomprojekt; 2.2 Zellen und Organismen; 2.3 Genome, Chromosomen und DNA; 2.3.1 Chemische Bindungen; 2.3.2 Aufbau und Funktion der DNA; 2.4 Proteine; 2.4.1 Aminosäuren; 2.4.2 Struktur von Proteinen; 2.4.3 Arten und Funktionen von Proteinen; 2.5 Genexpression; 2.6 Enzymatische Reaktionen; 2.7 Biologische Netzwerke; 2.7.1 Genregulatorische Netzwerke. 2.7.2 Signaltransduktionsnetzwerke2.7.3 Metabolische Netzwerke; 2.7.4 Proteininteraktionsnetzwerke; 2.8 Zusammenfassung; 3 Molekularbiologische Datenbanken und Austauschformate ; 3.1 Molekularbiologische Datenbanken; 3.1.1 Sequenzdatenbanken; 3.1.2 Strukturdatenbanken; 3.1.3 Genexpressionsdatenbanken; 3.1.4 Datenbanken über Proteinfunktionen; 3.1.5 Interaktionsdatenbanken; 3.1.6 Datenbanken für organismusbezogene Informationen; 3.1.7 Portale und Integrationsansätze; 3.1.8 Spezifische Merkmale molekularbiologischerDatenbanken; 3.2 Austauschformate. 3.2.1 SBML (Systems Biology Markup Language)3.2.2 CellML; 3.2.3 CSML (Cell Systems Markup Language); 3.2.4 Vergleich der Austauschformate; 3.3 Datenakquirierung; 3.3.1 Digitale Bibliotheken; 3.3.2 Information-Retrieval und Text-Mining; 3.4 Zusammenfassung; 4 Informationsintegration ; 4.1 Integrationsansätze; 4.1.1 Integrationsansätze in der Molekularbiologie; 4.2 Grundlagen d. semantischen Integration; 4.2.1 Ontologien; 4.2.2 Beschreibungslogiken; 4.2.3 Resource Description Framework (RDF); 4.2.4 RDF-Schema; 4.3 OWL; 4.3.1 Klassen, Eigenschaften und Individuen. 4.3.2 Header, Namensräume und Einbindung andererOntologien4.3.3 Unterschiede zwischen OWL Lite, OWL DLund OWL Full; 4.3.4 OWL 2; 4.4 Ontologien in der Molekularbiologie; 4.4.1 Gene Ontology; 4.4.2 Die „Open Biomedical Ontologies"-Initiative; 4.4.3 BioPAX; 4.5 Ontosync; 4.5.1 Abbildung von Datenbankschemataauf Ontologien; 4.5.2 Annotation von Ontologien; 4.5.3 Ontologievisualisierung; 4.5.4 Synchronisation von Ontologieund Datenbankschema; 4.5.5 Anfragebearbeitung; 4.5.6 Fazit; 4.6 Zusammenfassung; 5 Modellierung und Analyse biologischer Netzwerke ; 5.1 Einleitung. 5.2 Graphen5.2.1 Grundlagen; 5.2.2 Graphenmodelle; 5.2.3 Topologische Eigenschaften; 5.3 Rekonstruktion biologischer Netzwerke; 5.4 Netzwerkanalyse; 5.4.1 Genregulatorische Netzwerke; 5.4.2 Signaltransduktionsnetzwerke; 5.4.3 Metabolische Netzwerke; 5.4.4 Proteininteraktionsnetzwerke; 5.5 Stöchiometrische Analyse; 5.5.1 Elementary Flux Modes; 5.5.2 Extreme Pathways; 5.5.3 Flux Balance Analysis; 5.6 Modellierungsansätze im Überblick; 5.6.1 Modellierungsdimensionen; 5.6.2 Einordnung von Modellierungsansätzen; 5.6.3 Modellierungssprachen und ihre Anwendung in der Biologie. 5.7 Zusammenfassung |
| Titelhinweis |
Buchausg. u.d.T.: ‡Eckstein, Silke: Informationsmanagement in der Systembiologie |
| ISBN |
ISBN 978-3-642-18234-1 |
| Klassifikation |
UB |
| PSA |
| COM014000 |
| 570.11 |
| 570.285 |
| 572.8/0285 |
| QH324.2-324.25 |
| WD 9200 |
| WC 7700 |
| WD 9000 |
| ST 690 |
| Kurzbeschreibung |
Einleitung -- Biologische Grundlagen -- Datenbanken und Austauschformate -- Informationsintegration -- Modellierung biologischer Netzwerke -- Biologische netzwerke als Petri-Netze -- Literaturverzeichnis -- Index. |
| 2. Kurzbeschreibung |
Die Systembiologie untersucht, wie die Komponenten einer Zelle oder eines Organismus Interaktionsnetzwerke bilden und wie diese Netzwerke die Funktionen der Zelle hervorrufen, die dem beobachtbaren Erscheinungsbild - dem Phänotyp - entsprechen. Das vorliegende Buch bietet eine Informatikperspektive auf die Systembiologie mit einem Fokus auf Verwaltung, Austausch und Integration der anfallenden Daten sowie auf die Modellbildung mit unterschiedlichen Methoden. Dabei wird der Leser schrittweise von den Daten über die zur Verfügung stehenden Datenbanken und deren Integrationsmöglichkeiten hin zu verschiedenen Modellierungsansätzen mit unterschiedlichen Analysemöglichkeiten geführt. Die Autorin wendet sich an alle, die sich einen breiten, fundierten Überblick über das Gebiet verschaffen wollen und gibt zahlreiche Hinweise auf vertiefende Literatur zu den einzelnen Themen. |
| 1. Schlagwortkette |
Systembiologie |
| Datenverwaltung |
| Ontologie <Wissensverarbeitung> |
| Datenintegration |
| 1. Schlagwortkette ANZEIGE DER KETTE |
Systembiologie -- Datenverwaltung -- Ontologie -- Datenintegration |
| 2. Schlagwortkette |
Systembiologie |
| Netzwerk |
| Mathematisches Modell |
| 2. Schlagwortkette ANZEIGE DER KETTE |
Systembiologie -- Netzwerk -- Mathematisches Modell |
| 3. Schlagwortkette |
Informatik |
| Informationsintegration |
| Systembiologie |
| ANZEIGE DER KETTE |
Informatik -- Informationsintegration -- Systembiologie |
| SWB-Titel-Idn |
347107915 |
| Signatur |
Springer E-Book |
| Bemerkungen |
Elektronischer Volltext - Campuslizenz |
| Elektronische Adresse |
$uhttp://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-18234-1 |
| Internetseite / Link |
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| Siehe auch |
Inhaltstext |
| Siehe auch |
Volltext |
| Siehe auch |
Inhaltsverzeichnis |
| Siehe auch |
Einführung/Vorwort |
